Skip to content

trzebunia myślenice

2 miesiące ago

600 words

Chociaż fibrotyczne tkanki i fibroblasty badano głównie na poziomie RNA w stanie ustalonym (powszechnie określanym jako. Transkryptom .,. Chociaż mechanizmy regulujące inne etapy regulacyjne, takie jak stabilność RNA, również wpływają na poziomy RNA w stanie stacjonarnym), istnieją dowody na patologicznie regulowaną mRNA translacja w fibroblastach włóknistych (28). Rodzi to możliwość, że interakcje między ECM a fibroblastem mogą również wpływać na ekspresję genów na poziomie translacji. Aby zbadać względny udział włóknistego ECM i fibroblastu w patologicznej ekspresji genu, hodowaliśmy pierwotne IPF lub kontrolne fibroblasty płuc na odkomórkowionym ECM przygotowanym z IPF lub kontrolnych płuc i prowadziliśmy profilowanie całego genomu zarówno całkowitego stanu stacjonarnego, jak i związanego z polisomem. RNA (wzbogacony o mRNA ulegające translacji na białka). Tutaj pokazujemy, że dominującym czynnikiem odpowiedzialnym za patologiczną ekspresję genów jest chory ECM, a nie chory fibroblast, a geny wrażliwe na ECM są głównie modulowane na poziomie translacji. Ponadto, geny translacyjnie aktywowane przez IPF ECM są wzbogacone o białka ECM znalezione w płucu IPF (np. Kolagen, laminina). Sugeruje to model progresji choroby, w którym pętla sprzężenia zwrotnego między chorym ECM i fibroblastami propaguje zwłóknienie, koncepcję dobrze dopasowaną do charakterystycznego wzoru ciągłego rozprzestrzeniania podczas progresji IPF. Poszukując wspólnych elementów regulujących RNA wśród translacyjnie aktywowanych genów ECM, zidentyfikowaliśmy miR-29 jako potencjalny regulator pętli sprzężenia zwrotnego. Cele ECM miR-29 były preferencyjnie aktywowane przez IPF ECM, miR-29c był obniżony w IPF i kontrolował fibroblasty przez IPF ECM, a ektopowa nadekspresja miR-29c uratowała tę translacyjną aktywację genów ECM. Tak więc, nasze dane dostarczają bezpośredniego wglądu w molekularne podstawy progresji zwłóknienia w IPF przez ujawnienie pętli sprzężenia zwrotnego napędzanej ECM, która może przekierować ekspresję genu fibroblastów ECM przez zmniejszenie ekspresji miR-29, znanego silnego negatywnego regulatora genów ECM. Wyniki Patologiczna ekspresja genów w fibroblastach IPF jest napędzana głównie przez ECM. Aby zbadać względny udział pochodzenia komórek i pochodzenie ECM względem wzorców ekspresji genów we fibrotycznych fibroblastach, hodowaliśmy IPF lub kontrolowaliśmy fibroblasty na IPF lub kontrolnym ECM w doświadczalnym projekcie 2 x 2 (przy użyciu pierwotnych fibroblastów od 5 pacjentów z IPF i 5 pacjentami kontrolnymi ) (Rysunek 1A). Z każdej próbki zmierzono poziomy zarówno RNA w stanie stacjonarnym, jak i związanego z polisomem (Figura 1B). Aby ocenić, czy ten model in vitro odzwierciedla ekspresję genu fibroblastów in vivo, porównaliśmy profile RNA w stanie stacjonarnym z fibroblastów kontrolnych i IPF na ich natywnym ECM (fibroblasty IPF na IPF ECM w porównaniu z kontrolnymi fibroblastami na kontrolnym ECM) z opublikowanym zestawem danych badającym exulte niehodowlane fibroblasty (29). Testowaliśmy hipotezę, że te geny podwyższone lub obniżone w fibroblastach IPF na IPF ECM względem fibroblastów kontrolnych na kontrolnym ECM są podobnie regulowane w fibroblastach IFF ex vivo przez obliczenie Cohena. Statystyczny. Analiza ta wykazała jedynie niewielką zgodność między dwoma zestawami danych, ale większą niż można by oczekiwać na podstawie przypadku (= = 0,053, 95% CI: 0,032 0.0 0,075). Aby dodatkowo zbadać, czy ekspresja genu obserwowana w naszym systemie modelowym odpowiada temu obserwowanemu in vivo, testowaliśmy hipotezę, że geny regulowane w górę lub obniżone w fibroblastach IPF na IPF ECM są podobnie regulowane w opublikowanym zestawie danych porównującym RNA wyekstrahowany z migdałowatej tkanki IPF z RNA wyekstrahowanym z tkanki kontrolnej (30). Warto zauważyć, że badana tkanka zawiera wiele typów komórek, które mogłyby potencjalnie rozcieńczyć różnice w ekspresji genów, które są specyficzne dla fibroblastów
[przypisy: płytki krwi mpv, podgłośniowe zapalenie krtani, mydocalm opinie ]

0 thoughts on “trzebunia myślenice”