Skip to content

pogotowie ratunkowe w wałbrzychu wałbrzych

2 miesiące ago

245 words

Ponownie zaobserwowaliśmy marginalną zgodność między naszymi danymi a danymi in vivo (. = 0,026, 95% CI: 0,000. 0,053). Jednak nawet skromna zgodność między naszymi danymi a dwoma zewnętrznymi zestawami danych (jednym ex vivo i drugim in vivo). pomimo technicznych ograniczeń wynikających z różnych procedur izolacji komórek i rozcieńczonej sygnatury fibroblastów. popiera ideę, że nasz system modelowy wychwytuje niektóre istotne dla choroby różnice w ekspresji genów fibroblastów IPF, które występują in vivo. Figura Ekspresja genów patologicznych w fibroblastach włóknistych jest głównie regulowana przez ECM z chorobą. (A) Projekt eksperymentalny. IPF lub kontrolne fibroblasty hodowano na IPF lub kontrolnym ECM, stosując eksperymentalny projekt 2 x 2. (B) Izolacja RNA związanego z polisom. Próbka śledzenia polisomów wykazuje absorbancję przy 254 nm w gradiencie sacharozy. Transcripty, które ulegają translacji, są wzbogacone o RNA związane z polisom. Wskazano część gradientu zebranego do pomiaru poziomów RNA związanych z polisom. (C. H) Histogramy wartości P dla genu dla różnych porównań biologicznych. Linie przerywane przedstawiają teoretyczne rozkłady zerowe. (C. E) Porównanie poziomów RNA związanych z polisomami fibroblastów (C) IPF wysianych na IPF ECM i kontrolnych fibroblastach wysianych w kontrolnym ECM, (D) fibroblastach IPF i kontrolnych fibroblastach (niezależnych od typu ECM) i (E) IPF i kontroluj ECM (niezależnie od pochodzenia komórki). (F. H) Takie same porównania jak w A. C przy użyciu danych z ustalonego stanu RNA. (I) Geny, które wykazywały modulację pochodzenia komórek w RNA sprzężonym z polisomem (P <0,05) zarówno w naszym obecnym badaniu, jak iw poprzednim badaniu (dane z mikromacierzy uzyskanych z GSE11196) zebrano. Przedstawiono spasowane zmiany w poprzednim badaniu (oś x) oraz w naszym aktualnym zestawie danych (oś y). Geny podwyższone w jednym badaniu częściej ulegają zwiększeniu w drugim (. = 0,476, 95% CI = [0,269, 0,682]). (J) Histogram wartości P dla porównania RNA uzyskanego z komórek kontrolnych i IPF hodowanych w standardowych warunkach hodowli (dane z mikromacierzy uzyskanych z GEO GSE10921). Następnie skoncentrowaliśmy się na naszych danych z RNA związanego z polisomami, ponieważ dane na temat mRNA, które są lepiej tłumione, odpowiadają poziomom białka w porównaniu z danymi dotyczącymi mRNA w stanie ustalonym (27, 31). Zgodnie z oczekiwaniami analiza wykazała znaczne różnice między IPF i komórkami kontrolnymi na ich natywnej ECM, co stwierdzono na podstawie wzbogacenia niskich wartości P (Figura 1C). Aby określić, czy obserwowane różnice wynikały z zmian wewnątrzpochodnych fibroblastów, czy też wynikały z sygnałów odbierających fibroblasty z włóknistego ECM, porównaliśmy wpływ typu ECM (niezależny od pochodzenia komórek) z wpływem pochodzenia fibroblastów (niezależnie od ECM). rodzaj). Co znamienne, więcej genów było modulowanych przez typ ECM niż przez pochodzenie komórkowe (porównaj rys. 1, D i E; P <2,2 × 10. 16 przy użyciu testu Kołmogorowa-Smirnowa [KS]). Po skorygowaniu wartości P za pomocą procedury FDR (32) Benjaminiego-Hochberga (38), 389 genów wykazało istotne statystycznie (FDR <0,2) różnice w poziomie RNA związanego z polisomem między typami ECM (Tabela uzupełniająca 1, suplementacja materiał dostępny online z tym artykułem; doi: 10.1172 / JCI71386DS1). Przy tym progu FDR stwierdziliśmy, że tylko jeden gen był powiązany z pochodzeniem komórki. Zauważ, że jest to relatywnie permisywny próg FDR, pozwalający na 20% fałszywych alarmów. Chociaż nie jest to surowe kryterium do identyfikacji poszczególnych genów, analiza ta wykazała, że większość zmian obserwowanych w całym genomie była napędzana przez typ ECM. Uzyskaliśmy podobne wyniki, gdy tę samą analizę zastosowano do danych z RNA w stanie stacjonarnym: większość zaobserwowanych różnic wynikała z typu ECM, a nie z pochodzenia komórki (Figura 1, F. H; P <2,2 × 10. 16 przy użyciu Test KS). Stwierdziliśmy, że intrygujące jest to, że tak niewiele genów było powiązanych z pochodzeniem komórek [patrz też: streptococcus agalactiae w ciąży, neosine syrop opinie, gamma glutamylotranspeptydaza ]

0 thoughts on “pogotowie ratunkowe w wałbrzychu wałbrzych”

  1. [..] odnosnik do informacji w naukowej publikacji odnosnie: sklep z odżywkami warszawa[…]